剧情简介
继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。。春日新（松冈祯丞 配音）是一名平凡的少年，某日，一场意外让他和堂妹春日圣（诹访彩花 配音）一同被卷入了通往异世界的漩涡之中，在混乱中，新和圣失散了。为了找到圣，两人一同回到原来的世界中去，新追寻着种种线索进入了王立书册学院成为了那里的一名转校生。 性格严谨彬彬有礼的浅见莉莉斯（原由实 配音）、擅长暗杀拥有超强行动力的风间莱维（佐仓绫音 配音）、拥有强大魔力拒人于千里之外的山奈弥勒（日笠阳子 配音）、大大咧咧开朗好爽的不动秋音（柚木凉香 配音）、懵懵懂懂沉默寡言的神无月爱琳（内田彩 配音）、身份神秘特立独行的仓田唯（村川梨衣 配音）和莉瑟罗特（东山奈央 配音），在学院里，等待着新的是七位个性迥异的魔导书使者，在她们的陪伴下，有笑有泪的学院生活就此拉开序幕。。
